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2018微生物组学分析研讨班

时间:2018-11-28 09:30:12
会议时间:2018-11-28 09:30至 2018-11-30 17:00结束
会议地点: 北京  北京市计算中心  海淀区丰贤中路7号
会议规模:暂无
主办单位:中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会
 

近年来,微生物组学在医疗、环保、资源开发、科研领域都发挥着举足轻重的作用,成为了上述领域必不可少的研究技术。在此,北京市计算中心生物部为您提供了最前沿、最实用的微生物组学课程《微生物组学分析研讨班》。为您在微生物组学研究中样品制备、实验设计、数据分析、结果展示等方面的困扰提供一键式解决方案。

专业一流的讲课老师团队将与您一起探讨科研奥秘、挖掘科学价值,为您拓宽科研思路、解决实验困扰。欢迎报名参加!

主办单位:

中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会

承办单位:

北京市计算中心

协办单位:

云计算关键技术与应用北京市重点实验室

中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会

北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心

中国生物工程杂志

北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司

深圳微生太科技有限公司 

培训地点:北京海淀区丰贤中路7号3号楼

培训时间: 2018.11.28-30(报名中)本次课程时间:   上午:9:30-12:00下午:13:30-17:00

 

会议日程

 

(最终日程以会议现场为准)

日期

授课题目

授课内容

微生物组学研究的发展和挑战

1、微生物组研究的发展历史

2、测序平台介绍

3、基于测序的研究方法

3.1 宏基因组(target sequencing 和全基因组)

3.2 单个微生物de novo测序

4、应用案例分析

target sequencing数据分析

1、linux常用命令使用和上机操作

2、数据分析过程中的编程简介(perl、R、python等)

3、target sequencing数据分析加上机

3.1质控

3.2去嵌合体

3.3 OTU聚类

3.4 注释

3.5统计分析:(1)α多样性分析;(2)β多样性分析;(3)群落结构及丰度分析;(4)进化分析;(5)差异分析(Lefse);(6)功能分析(picrust)。

Whole metagenome 和metatranscriptome数据分析

1、质控

2、拼接组装:SOAPdenovo;MetaVelvet; Meta-IDBA等

3、聚类Binning:TETRA; MetaCluster; Phymm等

4、基因注释:FragGeneScan;MetaGeneMark;MetaGeneAnnotator等

5、功能注释:RAMMCAP;Blast等

6、统计分析:(1)物种分析;(2)功能分析;(3)差异分析;(4)表达分析

 

微生物de novo测序分析

1、 质控

2、 单细胞测序去污染、去嵌合体等

3、拼接组装:SPAdes等

4、基因预测

5、功能注释

6、代谢途径分析

7、进化分析:(1)SNP;(2)插入缺失(3)水平基因转移;

8、转录组分析:(1)基因差异表达分析;(2)代谢通路分析




 

【报名费用】  注册费:4000元/人(含听课费、资料费、上机费,请自带笔记本电脑以备上机实践使用)。材料:《高通量测序与高性能计算理论和实践》北京科学技术出版社

报名优惠政策

   1、11.1日前报名并缴费的学员每人可优惠200元; 

   2、3人以上团体报名每人可减少300元;

   3、 4+1团报,可免费赠送一个名额;               

   4、上面4种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。

培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。