感染性疾病，顾名思义，就是病人在治病期间，由于抵抗力较弱，感染了一些病原菌而导致了其他疾病。一方面，病原菌的入侵极易改变身体内正常的菌群结构；另一方面，抗生素的使用也进一步加剧了肠道菌群的紊乱。研究表明，在使用抗生素抗感染的治疗过程中，肠道双歧杆菌、乳酸杆菌及大肠杆菌显著减少，导致菌群失调。益生菌的减少一方面使得碳水化合物不能酵解成乳酸和短链脂肪酸，使得初级胆汁酸积滞在肠道而导致渗透性腹泻；另一方面少数有害菌得以大量繁殖，产生氨类和内毒素，造成腹泻。通过补充益生菌，可以提高患者自身免疫力，从而减轻疾病。
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