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2015(第二届)微生物生态生物信息技术研讨会
时间:2015-02-02 08:00:00
由于微生物个体小、数量大、世代周期短,并且在环境中绝大多数尚不可培养,微生物多样性研究受到了巨大限制,从而制约了微生物生态学的发展。
近年来,随着高通量测序等现代分子生物学技术的突破,人们可以从基因水平测定不可培养微生物的群落组成和功能多样性,使得自 21 世纪以来微生物生态学成为目前微生物学、地理学以及生态学领域最为重要的交叉学科之一。
当前,高通量测序手段日新月异,主流测序已由 454 转变为 IlluminaHiSeq 和 MiSeq。然而,庞大数据量的产生为微生物生态学发展带来新机遇的同时,也带来了挑战。海量数据、纷繁复杂的土壤气候环境变量,使我们在选择合适的数理统计工具时更加困惑。
基于此,中国土壤学会已于 2013 年 2 月 25-28 日成功举办了“第一届微生物生态研讨会暨生物信息分析培训班”。这次会议使大家对高通量数据分析手段有了更深入的认识,也使大家得到了广泛的交流。然而,目前纷繁复杂的统计分析工具以及方法选择还是我们在微生物生态研究的重要阻碍。
因此,中国土壤学会将于 2015 年 2 月 2 日-4 日举办“第二届微生物生态生物信息技术研讨会”。会议邀请国内知名微生物生态学家,及美国阿贡国家实验室 Jack Anthony Gilbert 教授和密歇根州立大学 Ashley Lauren Shade 教授及其团队作微生物生态领域专题报告,随后Gilbert 和 Shade 教授及其团队成员对高通量测序(Illumina HiSeq 和 MiSeq)后续的生物信息分析进行系统讲解。
会议主题:
1、Illumina Hiseq 的生物信息分析:环境中微生物全基因组的数据分析; MG-RAST 以及云计算在高通量数据分析中的运用;
2、微生物群落预测模型、代谢模型:Artificial Neural Network (ANN),Microbial AssemblagePrediction(MAP),Predicted Relative Metabolomic Turnover (PRMT),种分布预测模型Species distribution modeling 等在微生物生态上的运用;
3、Illumina Miseq 测序的生物信息分析:包括如何使用 QIIME 进行数据处理以及在分析中应注意的问题,如何使用 R 和其他分析软件进行分析统计及制图-PCA、RDA、DCA、CCA、NMDS、CLUSTER、MNTD 等;
会议时间:
2 月 3 日微生物生态生物信息技术研讨会
2 月 4 日微生物生态生物信息技术研讨会
会议规模:
150 人左右
组织机构:
主办单位:中国土壤学会土壤生物与生物化学专业委员会
承办单位:中国科学院南京土壤研究所 土壤与农业可持续发展国家重点实验室
会议门票
参会费用:
1500元/人
注:参会费用包含会议手册、提供午餐、晚餐券。
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