对于健康的人而言，酸奶、康普茶、开菲尔、泡菜、纳豆等发酵食物对于维持健康的肠道菌群是有益的。然而，发酵食物中的菌种并不完全可控，里面存在的菌株可能无法满足特定健康状况的需求。
另外，组胺不耐受可能是某些人的问题。我们的消化道需要一定量的组胺来维持其正常的运行，然而出于某些原因，一部分人的消化道中会有过量的组胺释放，从而有过敏反应样症状——这就是我们所说的组胺不耐受。对于这部分组胺不耐受的人来说，需要暂时地避免高组胺的食物，其中就包括发酵食物。这个时候，如果需要补充益生菌，他们更适合使用能降低组胺的益生菌补充剂。
另外，组胺不耐受可能是某些人的问题。我们的消化道需要一定量的组胺来维持其正常的运行，然而出于某些原因，一部分人的消化道中会有过量的组胺释放，从而有过敏反应样症状——这就是我们所说的组胺不耐受。对于这部分组胺不耐受的人来说，需要暂时地避免高组胺的食物，其中就包括发酵食物。这个时候，如果需要补充益生菌，他们更适合使用能降低组胺的益生菌补充剂。
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